O projektu
Projekt COPILOT se zaměřuje na využití nejmodernějších metod aplikované analytické chemie (omické metody) v oblasti výzkumu perinatálního vývoje člověka a ontogeneze. Tato témata propojují odborníky na fyziologii a biochemii s odborníky v oblasti analytické chemie s klinickými pracovišti specializovanými na péči o nedonošené děti.
Témata
Optimalizace složení výživy předčasně narozených dětí.
Aplikační potenciál bioaktivních lipidů mázku a amniochorionu.
Charakterizace lipidomu mateřského mléka, novorozeneckého mázku a placentárních membrán.
Komplexní rozvoj lipidomických metod pro základní výzkum i klinickou praxi.
Výzkumný materiál
Výsledky z neonatologického výzkumu
Předčasný porod
Předčasný porod (porod před 37. týdnem těhotenství) a jeho komplikace jsou hlavními příčinami úmrtí dětí mladších pěti let. Zejména těžce až extrémně nezralí novorozenci (děti porozené před zhruba 32. týdnem těhotenství), mají často dlouhodobé zdravotní problémy, včetně neurologických, vývojových a metabolických poruch. Česká republika patří k zemím s nejlepší péčí o novorozence, což dokumentuje nízká novorozenecká morbidita a mortalita, ale počet předčasně narozených dětí se zvyšuje a v současné době dosahuje 8 %. Výzkum v perinatálním období umožní zlepšít péči o nedonošené děti.
Tissue metabolism and plasma levels of thyroid hormones in critically ill very premature infants. Pavelka S, Kopecký P, Bendlová B, Stolba P, Vítková I, Vobruba V, Plavka R, Houstek J, Kopecký J. Pediatr Res. 1997 Dec;42(6):812-8. doi: 10.1203/00006450-199712000-00016. PMID: 9396563
Type II iodothyronine 5'-deiodinase and uncoupling protein in brown adipose tissue of human newborns. Houstĕk J, Vízek K, Pavelka S, Kopecký J, Krejcová E, Hermanská J, Cermáková M. J Clin Endocrinol Metab. 1993 Aug;77(2):382-7. doi: 10.1210/jcem.77.2.8393883. PMID: 8393883
Expression of uncoupling protein 3 and GLUT4 gene in skeletal muscle of preterm newborns: possible control by AMP-activated protein kinase. Brauner P, Kopecky P, Flachs P, Kuda O, Vorlicek J, Planickova L, Vitkova I, Andreelli F, Foretz M, Viollet B, Kopecky J. Pediatr Res. 2006 Nov;60(5):569-75. doi: 10.1203/01.PDR.0000242301.64555.e2. Epub 2006 Sep 11. PMID: 16966355
Mateřské mléko
Mateřské mléko je produkované během laktace v mléčných žlázách a slouží k výživě novorozeného potomka. Mateřské mléko je přirozená strava pro novorozence, která by měla poskytnout veškeré potřebné látky pro růst organismu. Mléko matek, které porodily předčasně, má vyšší obsah bílkovin a minerálů, a obsahuje různé druhy tuků (lipidů), které se snáze stráví a vstřebávají. Tuk v mateřském mléce pomáhá podporovat vývoj mozku a neurologických tkání dítěte, což je zvláště důležité pro předčasně narozené děti. Pro správný vývoj dítěte se v současné době doporučuje minimálně půlroční plné kojení.
Reverting to a Healthy Diet during Lactation Normalizes Maternal Milk Lipid Content of Diet-Induced Obese Rats and Prevents Early Alterations in the Plasma Lipidome of the Offspring. Castillo P, Kuda O, Kopecky J, Pomar CA, Palou A, Palou M, Picó C. Mol Nutr Food Res. 2022 Sep;66(17):e2200204. doi: 10.1002/mnfr.202200204. Epub 2022 Jul 13. PMID: 35772018
Triacylglycerols containing branched palmitic acid ester of hydroxystearic acid (PAHSA) are present in the breast milk and hydrolyzed by carboxyl ester lipase. Brejchova K, Paluchova V, Brezinova M, Cajka T, Balas L, Durand T, Krizova M, Stranak Z, Kuda O. Food Chem. 2022 Sep 15;388:132983. doi: 10.1016/j.foodchem.2022.132983. Epub 2022 Apr 15. PMID: 35486985
Maternal diet, rather than obesity itself, has a main influence on milk triacylglycerol profile in dietary obese rats. Pomar CA, Kuda O, Kopecky J, Rombaldova M, Castro H, Picó C, Sánchez J, Palou A. Biochim Biophys Acta Mol Cell Biol Lipids. 2020 Feb;1865(2):158556. doi: 10.1016/j.bbalip.2019.158556. Epub 2019 Oct 31. PMID: 31678620
Levels of palmitic acid ester of hydroxystearic acid (PAHSA) are reduced in the breast milk of obese mothers. Brezinova M, Kuda O, Hansikova J, Rombaldova M, Balas L, Bardova K, Durand T, Rossmeisl M, Cerna M, Stranak Z, Kopecky J. Biochim Biophys Acta Mol Cell Biol Lipids. 2018 Feb;1863(2):126-131. doi: 10.1016/j.bbalip.2017.11.004. Epub 2017 Nov 14. PMID: 29154942
Novorozenecký mázek
Novorozenecký mázek (vernix caseosa) je bílý, krémovitý biofilm, který pokrývá pokožku plodu od začátku třetího trimestru těhotenství. Je produktem vyvíjející se kůže plodu. Skládá se z lipidů kožních buněk a mazových žláz, proteinů, zbytků kožního epitelu, lanuga a vody. Novorozenecký mázek plní řadu funkcí v perinatálním období. Před porodem poskytuje plodu ochranu před macerací v plodové vodě, po porodu pak pomáhá udržet dostatečnou úroveň hydratace pokožky, má regenerační účinky a zajišťuje optimální pH pro zamezení růstu patogenních bakterií.
Analysis of (O-acyl) alpha- and omega-hydroxy fatty acids in vernix caseosa by high-performance liquid chromatography-Orbitrap mass spectrometry. Vavrušová A, Vrkoslav V, Plavka R, Bosáková Z, Cvačka J. Anal Bioanal Chem. 2020 Apr;412(10):2291-2302. doi: 10.1007/s00216-019-02348-2. Epub 2020 Jan 6. PMID: 31907593
Combining Charge-Switch Derivatization with Ozone-Induced Dissociation for Fatty Acid Analysis. Poad BLJ, Marshall DL, Harazim E, Gupta R, Narreddula VR, Young RSE, Duchoslav E, Campbell JL, Broadbent JA, Cvačka J, Mitchell TW, Blanksby SJ. J Am Soc Mass Spectrom. 2019 Oct;30(10):2135-2143. doi: 10.1007/s13361-019-02285-5. Epub 2019 Jul 25. PMID: 31347025
Nonhydroxylated 1-O-acylceramides in vernix caseosa. Harazim E, Vrkoslav V, Buděšínský M, Harazim P, Svoboda M, Plavka R, Bosáková Z, Cvačka J. J Lipid Res. 2018 Nov;59(11):2164-2173. doi: 10.1194/jlr.M088864. Epub 2018 Sep 25. PMID: 30254076
Cholesteryl esters of ω-(O-acyl)-hydroxy fatty acids in vernix caseosa. Kalužíková A, Vrkoslav V, Harazim E, Hoskovec M, Plavka R, Buděšínský M, Bosáková Z, Cvačka J. J Lipid Res. 2017 Aug;58(8):1579-1590. doi: 10.1194/jlr.M075333. Epub 2017 Jun 2. PMID: 28576934
Analysis of 1,2-diol diesters in vernix caseosa by high-performance liquid chromatography - atmospheric pressure chemical ionization mass spectrometry. Šubčíková L, Hoskovec M, Vrkoslav V, Čmelíková T, Háková E, Míková R, Coufal P, Doležal A, Plavka R, Cvačka J. J Chromatogr A. 2015 Jan 23;1378:8-18. doi: 10.1016/j.chroma.2014.11.075. Epub 2014 Dec 4. PMID: 25555408
Newborn boys and girls differ in the lipid composition of vernix caseosa. Míková R, Vrkoslav V, Hanus R, Háková E, Hábová Z, Doležal A, Plavka R, Coufal P, Cvačka J. PLoS One. 2014 Jun 9;9(6):e99173. doi: 10.1371/journal.pone.0099173. eCollection 2014. PMID: 24911066
Placentární obaly
Zdravá placenta, stejně jako placentární obaly, amniová, choriová a amniochoriová membrána jsou nezbytné pro fyziologický vývoj plodu. Tyto tkáně, podobně jako pupečníková krev, mohou být využity k výzkumným účelům. Přítomnost kmenových buněk a řady bioaktivních molekul (bioaktivní proteiny i lipidy) je předurčuje k bohatému využití v tkáňovém inženýrství.
The healing dynamics of non-healing wounds using cryo-preserved amniotic membrane. Svobodova A, Horvath V, Smeringaiova I, Cabral JV, Zemlickova M, Fiala R, Burkert J, Nemetova D, Stadler P, Lindner J, Bednar J, Jirsova K. Int Wound J. 2022 Aug;19(5):1243-1252. doi: 10.1111/iwj.13719. Epub 2021 Nov 17. PMID: 34791774
Amniotic membrane in ophthalmology: properties, preparation, storage and indications for grafting-a review. Jirsova K, Jones GLA. Cell Tissue Bank. 2017 Jun;18(2):193-204. doi: 10.1007/s10561-017-9618-5. Epub 2017 Mar 2. PMID: 28255771
Rapid cooling of the amniotic membrane as a model system for the vitrification of posterior corneal lamellae. Krabcova I, Jirsova K, Bednar J. Cell Tissue Bank. 2014 Mar;15(1):165-73. doi: 10.1007/s10561-013-9388-7. Epub 2013 Jul 27. PMID: 23893330
Partneři
Fyziologický ústav AV ČR
FGÚ je významnou veřejnou výzkumnou institucí AV ČR v rámci České republiky v oblastech normální a patologické fyziologie. Náplní práce FGÚ je studium mechanismů vzniku závažných onemocnění člověka, jako např. cévní a mozkové příhody, ischemická choroba srdeční, diabetes, dědičné metabolické poruchy a neurodegenerativní onemocnění, s cílem připravit teoretické základy pro nové preventivní, diagnostické a terapeutické postupy v boji proti celospolečensky závažným chorobám. FGÚ dlouhodobě systematicky rozvíjí zvířecí modely uvedených onemocnění, zejména na laboratorních myších a potkanech. FGU také disponuje unikátními metodami celotělové fenotypizace metabolismu, vlastností kardiovaskulárního systému nebo citlivosti k inzulínu laboratorních zvířat, které budou dále rozvíjeny v rámci tohoto projektu. FGÚ dosahuje vynikajících výsledků při získávání grantových projektů a při řešení výzkumných úkolů. FGÚ se podílí na vzdělávání na universitní úrovni, vedení diplomových a doktorských prací a je sídlem komise pro obhajoby doktorských disertací (DSc.) v oboru fyziologie. FGÚ je rovněž jedním z prvních pracovišť v České republice, které dosáhlo ocenění HR award, jako důkaz excelence v organizaci práce a péči o rozvoj lidských zdrojů.
FGÚ AV ČR
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR
ÚOCHB AV ČR je jedna z nejvýznamnějších českých veřejných výzkumných institucí v oblastech základního výzkumu v organické chemii, biochemii, teoretické chemii a v dalších souvisejících disciplínách. Současně je přední českou institucí, která dosáhla mezinárodního úspěchu v aplikovaném výzkumu orientovaném do vývoje léků a životního prostředí. Spolupráce organických chemiků a biochemiků z ÚOCHB s virology z Belgie a americké farmaceutické společnosti Gilead Sciences vyústila v uvedení léků proti HIV a hepatitidě B do klinické praxe. Unikátní kombinace odborných znalostí v syntetické a medicinální chemii, široké zázemí v molekulární biologii, virologii a biochemii v kombinaci s originálními přístupy v teoretické chemii představují v evropském kontextu mimořádné předpoklady pro řešení interdisciplinárních výzkumných projektů. ÚOCHB se podílí na vzdělávání na universitní úrovni, vedení diplomových a doktorských prací a je sídlem komise pro obhajoby doktorských disertací (DSc.) v oboru organická a bioorganická chemie. ÚOCHB rozvíjí výsledky základního výzkumu uplatnitelné v praxi a pomáhá jejich transferu do světa obchodu s pomocí dceřiné společnosti IOCB Tech. ÚOCHB AV ČR získal ocenění HR Award dne 12. listopadu 2021. ÚOCHB AV ČR poskytuje pozitivní pracovní prostředí všem zaměstnancům bez ohledu na jejich národnost, pohlaví, etnický původ nebo zdravotní postižení. Tyto zásady byly formalizovány v rámci Plánu rovných příležitostí, který byl schválen 29. října 2021 a je platný do 31. prosince 2026.
ÚOCHB AV ČR
Univerzita Karlova - 1. lékařská fakulta
Univerzita Karlova (UK) je mezinárodně uznávanou univerzitou výzkumného typu („research university“). UK je spolu s Akademií věd ČR podle oficiálních hodnocení vědeckých výstupů (hodnocení Rady pro výzkum, vývoj a inovace) nejvýkonnější vědeckou institucí v ČR. Podle národního hodnocení výsledků tvoří pracoviště UK 24 % vědeckého výkonu českých vysokých škol a 15 % výkonu České republiky. V rámci programů Horizont 2020 a Horizon Europe se UK podílela nebo podílí na realizaci více než 160 projektů. UK je nositelem 12 ERC projektů (přehledně zde), je hostitelem pěti velkých výzkumných infrastruktur, zařazených do Cestovní mapy velkých výzkumných infrastruktur ČR 2016 – 2022, a v dalších je zapojena v roli partnera (přehledně zde). 1. lékařská fakulta UK (1. LF UK) je významným centrem lékařského a biomedicínského výzkumu v ČR i v mezinárodním měřítku. Velká část výsledků výzkumu probíhajícího na 1. LF UK nachází uplatnění v aplikační sféře, o čemž svědčí řada patentů, českých i mezinárodních, či užitných a průmyslových vzorů. Fakulta, ve spolupráci s univerzitním Centrem pro přenos poznatků a technologií (Centrum pro přenos poznatků a technologií), se systematicky zaměřuje na podporu a rozvoj transferu technologií a přenosu poznatků z akademického prostředí do aplikační sféry, i na vznik spin-off společností navazujících na poznatky vzešlé z výsledků vědců z 1. LF UK. V současné době je 1. LF UK součástí řady významných domácích i mezinárodních projektů (viz. Granty a projekty - 1. lékařská fakulta Univerzity Karlovy).
Univerzita Karlova
Univerzita Pardubice - Fakulta chemicko-technologická
Univerzita Pardubice (UPCE) je veřejná vysoká škola, jejíž tradice sahá do roku 1950. V současné době má 7 fakult, 7 000 studentů, více než 700 akademických a vědecko-výzkumných pracovníků, 500 dalších zaměstnanců.
Fakulta chemicko-technologická (FChT) se skládá z 12 kateder a Centra pro materiály a nanotechnologie. Fakulta poskytuje vzdělání ve všech třech typech studijních programů (bakalářském, magisterském a doktorském). Vědecká excelence je základem výzkumných a inovačních aktivit FChT. O špičkové kvalitě prováděného základního výzkumu svědčí množství publikací v impaktovaných časopisech. V řadě výzkumných oborů patří výzkumné skupiny na FChT ke špičce ve svém oboru v České republice a k mezinárodně uznávaným týmům. Výsledky výzkumu často nacházejí uplatnění v aplikační sféře a je rozvíjena řada partnerství se soukromými firmami. Výzkumní pracovníci FChT úspěšně získávají národní a mezinárodní granty. Pokud jde o mezinárodní granty, FChT realizovala několik projektů v rámci rámcových programů (od 6. RP až po současný Horizont Evropa), vč. prestižního ERC Starting grantu.
UPCE
Spolupracující neonatologická centra
Ústav pro péči o matku a dítě v Praze – Podolí
Ústav pro péči o matku a dítě v Praze – Podolí (ÚPMD) je špičkové zdravotnické zařízení, které se specializuje na poskytování zdravotních služeb v základních oborech gynekologie a porodnictví a neonatologie a v řadě komplementárních oborů, které úzce souvisí s péčí o ženu a dítě. Jedná se o jedno z největších gynekologicko-porodnických a novorozeneckých pracovišť v České republice. Každoročně se v ÚPMD narodí v průměru 5 500 dětí, z toho 500 novorozenců s porodní váhou pod 2500 g a 135 dětí s hmotností dokonce pod 1500 g. Každý sedmé dítě v ČR s porodní hmotností pod 1500 gramů se narodí právě v ÚPMD.
ÚPMD
Gynekologicko-porodnická klinika 1. LF UK a VFN
Gynekologicko-porodnická klinika 1. lékařské fakulty Univerzity Karlovy (LF UK) a Všeobecné fakultní nemocnice v Praze (VFN) „Porodnice u svatého Apolináře“ (SvApo) zajišťuje léčebně-preventivní péči i pedagogickou a vědecko-výzkumnou činnost. V budově sídlí také Perinatologické centrum pro Prahu a Středočeský kraj I. typu, které slouží jako superkonziliární pracoviště pro nejzávažnější těhotenské patologie z celé České republiky. V posledních letech se v této porodnici narodí kolem 4 600 dětí ročně.
SvApo
Fakultní nemocnice Hradec Králové
Porodnická a gynekologická klinika Fakultní nemocnice Hradec Králové (FNHK) patří mezi síť perinatologických center zajišťujících nejvyšší možnou dostupnou péči o těhotné ženy, rodičky, novorozence a o předčasně narozené děti v České Republice. Každý rok se zde narodí přes 2500 novorozenců.
FNHK
Fakultní nemocnice Olomouc
Novorozenecké oddělení Fakultní nemocnice Olomouc (FNOL) pečuje o novorozence se závažnými onemocněními, která ohrožují život a zdraví dětí. Jsou to jak děti předčasně narozené, tak děti narozené v termínu, ale se závažnými onemocněními (vrozené vady, infekční onemocnění atd.). V posledních letech se v této porodnici narodí kolem 2 200 dětí ročně.
FNOL
Kontakt
